Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp9yF8VPU6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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