Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm5798F7BTS7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm5798F7BTS7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm5798F7BTS7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Gm5798F7BTS7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5798F7BTS7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5798F7BTS7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5798F7BTS7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5798F7BTS7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Gm5798F7BTS7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm5798F7BTS7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5798F7BTS7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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