Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm5218F6YH22 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms