Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brd1E9PZ26 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms