Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc17E9PVB5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc17E9PVB5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms