Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syde2E9PUP1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms