Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd1D3YXK1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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