Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
BC048679D3YXE9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms