Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprbB2RU80 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms