Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ambra1A2AH22 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms