Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc163A2AGD7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms