Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

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Length 1,818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Itgb4A2A863 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Itgb4A2A863 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Itgb4A2A863 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Itgb4A2A863 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Itgb4A2A863 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Itgb4A2A863 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Itgb4A2A863 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Itgb4A2A863 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Itgb4A2A863 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Itgb4A2A863 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Itgb4A2A863 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms