Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc112A0AUP1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc112A0AUP1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc112A0AUP1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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