Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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