Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm5538W4VSP6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5538W4VSP6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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