Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top3bQ9Z321 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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