Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nme3Q9WV85 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms