Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms