Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gfra4Q9JJT2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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