Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Riox1Q9JJF3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Riox1Q9JJF3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms