Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Lmbr1Q9JIT0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Lmbr1Q9JIT0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1Q9JIT0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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