Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms