Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clstn2Q9ER65 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms