Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Capn12Q9ER56 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Capn12Q9ER56 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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