Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rhox9Q9EQM5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rhox9Q9EQM5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rhox9Q9EQM5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhox9Q9EQM5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhox9Q9EQM5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhox9Q9EQM5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhox9Q9EQM5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhox9Q9EQM5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rhox9Q9EQM5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rhox9Q9EQM5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms