Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sil1Q9EPK6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sil1Q9EPK6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms