Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syde1Q9DBZ9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms