Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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