Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms