Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms