Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Rep15Q9D7T1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rep15Q9D7T1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rep15Q9D7T1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rep15Q9D7T1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rep15Q9D7T1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rep15Q9D7T1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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