Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms