Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc7Q9D541 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms