Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms