Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Tmem88Q9D0N8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem88Q9D0N8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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