Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Snx7Q9CY18 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Snx7Q9CY18 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Snx7Q9CY18 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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