Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Sgo1Q9CXH7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sgo1Q9CXH7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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