Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cnih4Q9CX13 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms