Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Pfdn1Q9CWM4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Pfdn1Q9CWM4 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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