Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Lhfpl3Q9CTN8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms