Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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