Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Chmp3Q9CQ10 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chmp3Q9CQ10 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms