Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cep41Q99NF3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 322.2 ms