Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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