Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrrtQ99MR6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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