Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atp1b4Q99ME6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms