Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Tm2d1Q99MB3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm2d1Q99MB3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm2d1Q99MB3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm2d1Q99MB3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm2d1Q99MB3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tm2d1Q99MB3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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