Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TrabdQ99JY4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TrabdQ99JY4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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