Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Smim11aQ99J19 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Smim11aQ99J19 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Smim11aQ99J19 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Smim11aQ99J19 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Smim11aQ99J19 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Smim11aQ99J19 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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Smim11aQ99J19 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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