Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CsprsQ99388 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms